MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Neorickettsia risticii str. Illinois

Total Repeats: 15777

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013009	GAA	2	6	106	111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254796401
2	NC_013009	A	9	9	117	125	100 %	0 %	0 %	0 %	254796401
3	NC_013009	ATA	2	6	142	147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254796401
4	NC_013009	TAG	2	6	281	286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254796401
5	NC_013009	CGA	2	6	348	353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254796401
6	NC_013009	CTTT	2	8	430	437	0 %	75 %	0 %	25 %	254796401
7	NC_013009	AGA	2	6	462	467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254796401
8	NC_013009	GC	3	6	589	594	0 %	0 %	50 %	50 %	254796401
9	NC_013009	A	8	8	595	602	100 %	0 %	0 %	0 %	254796401
10	NC_013009	A	7	7	619	625	100 %	0 %	0 %	0 %	254796401
11	NC_013009	A	9	9	647	655	100 %	0 %	0 %	0 %	254796401
12	NC_013009	AG	3	6	660	665	50 %	0 %	50 %	0 %	254796401
13	NC_013009	AG	3	6	759	764	50 %	0 %	50 %	0 %	254796401
14	NC_013009	CTT	2	6	878	883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254796402
15	NC_013009	TAC	2	6	924	929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254796402
16	NC_013009	TCT	2	6	930	935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254796402
17	NC_013009	AG	3	6	1004	1009	50 %	0 %	50 %	0 %	254796402
18	NC_013009	TTCTA	2	10	1014	1023	20 %	60 %	0 %	20 %	254796402
19	NC_013009	GGT	2	6	1031	1036	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254796402
20	NC_013009	TGG	2	6	1148	1153	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254796402
21	NC_013009	GGA	2	6	1167	1172	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	254796402
22	NC_013009	TAAA	2	8	1198	1205	75 %	25 %	0 %	0 %	254796402
23	NC_013009	AAC	2	6	1214	1219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254796402
24	NC_013009	AGG	2	6	1224	1229	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	254796402
25	NC_013009	TGT	2	6	1346	1351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254796402
26	NC_013009	AGTT	2	8	1456	1463	25 %	50 %	25 %	0 %	254796402
27	NC_013009	T	7	7	1511	1517	0 %	100 %	0 %	0 %	254796402
28	NC_013009	T	6	6	1519	1524	0 %	100 %	0 %	0 %	254796402
29	NC_013009	CT	3	6	1526	1531	0 %	50 %	0 %	50 %	254796402
30	NC_013009	AAAAG	2	10	1578	1587	80 %	0 %	20 %	0 %	254796402
31	NC_013009	TTC	2	6	1669	1674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254796402
32	NC_013009	A	6	6	1695	1700	100 %	0 %	0 %	0 %	254796402
33	NC_013009	TGG	2	6	1711	1716	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254796402
34	NC_013009	GAGAA	2	10	1743	1752	60 %	0 %	40 %	0 %	254796402
35	NC_013009	TAA	2	6	1825	1830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254796402
36	NC_013009	TAAC	2	8	1837	1844	50 %	25 %	0 %	25 %	254796402
37	NC_013009	TGT	2	6	1848	1853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254796402
38	NC_013009	TTGG	2	8	1881	1888	0 %	50 %	50 %	0 %	254796402
39	NC_013009	GTTT	2	8	1924	1931	0 %	75 %	25 %	0 %	254796402
40	NC_013009	GAT	2	6	1962	1967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254796402
41	NC_013009	GAG	2	6	1986	1991	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	254796402
42	NC_013009	TG	3	6	2000	2005	0 %	50 %	50 %	0 %	254796402
43	NC_013009	TAG	2	6	2030	2035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254796402
44	NC_013009	CAGTTG	2	12	2047	2058	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	254796402
45	NC_013009	A	6	6	2068	2073	100 %	0 %	0 %	0 %	254796402
46	NC_013009	GAG	2	6	2087	2092	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	254796402
47	NC_013009	CTT	2	6	2147	2152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254796402
48	NC_013009	GCG	2	6	2246	2251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254796403
49	NC_013009	AAC	2	6	2281	2286	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254796403
50	NC_013009	CTTC	2	8	2294	2301	0 %	50 %	0 %	50 %	254796403
51	NC_013009	CGT	2	6	2376	2381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254796403
52	NC_013009	AG	3	6	2419	2424	50 %	0 %	50 %	0 %	254796403
53	NC_013009	TTA	2	6	2514	2519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254796403
54	NC_013009	TATCTT	2	12	2632	2643	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	254796403
55	NC_013009	T	6	6	2642	2647	0 %	100 %	0 %	0 %	254796403
56	NC_013009	GTT	2	6	2654	2659	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254796403
57	NC_013009	GTT	2	6	2722	2727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254796403
58	NC_013009	AAT	2	6	2787	2792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254796403
59	NC_013009	TAT	2	6	2863	2868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254796403
60	NC_013009	TCT	2	6	2936	2941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254796403
61	NC_013009	CTTT	2	8	2945	2952	0 %	75 %	0 %	25 %	254796403
62	NC_013009	T	7	7	2956	2962	0 %	100 %	0 %	0 %	254796403
63	NC_013009	GTTC	2	8	2985	2992	0 %	50 %	25 %	25 %	254796403
64	NC_013009	TCA	2	6	3018	3023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254796403
65	NC_013009	AAC	2	6	3053	3058	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254796403
66	NC_013009	TCT	2	6	3149	3154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254796403
67	NC_013009	TAT	2	6	3175	3180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254796403
68	NC_013009	GAA	2	6	3206	3211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254796403
69	NC_013009	GAT	2	6	3240	3245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254796403
70	NC_013009	TTG	2	6	3263	3268	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254796403
71	NC_013009	CT	3	6	3476	3481	0 %	50 %	0 %	50 %	254796403
72	NC_013009	TGC	2	6	3483	3488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254796403
73	NC_013009	T	7	7	3500	3506	0 %	100 %	0 %	0 %	254796403
74	NC_013009	AGT	2	6	3536	3541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254796403
75	NC_013009	TA	3	6	3571	3576	50 %	50 %	0 %	0 %	254796403
76	NC_013009	GTA	2	6	3656	3661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254796404
77	NC_013009	TGG	2	6	3664	3669	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	254796404
78	NC_013009	TA	3	6	3705	3710	50 %	50 %	0 %	0 %	254796404
79	NC_013009	AGG	2	6	3857	3862	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	254796404
80	NC_013009	TGGA	2	8	3874	3881	25 %	25 %	50 %	0 %	254796404
81	NC_013009	ATAG	2	8	3887	3894	50 %	25 %	25 %	0 %	254796404
82	NC_013009	T	8	8	3949	3956	0 %	100 %	0 %	0 %	254796404
83	NC_013009	A	6	6	3979	3984	100 %	0 %	0 %	0 %	254796404
84	NC_013009	CT	3	6	4002	4007	0 %	50 %	0 %	50 %	254796404
85	NC_013009	CA	3	6	4111	4116	50 %	0 %	0 %	50 %	254796404
86	NC_013009	AG	3	6	4138	4143	50 %	0 %	50 %	0 %	254796404
87	NC_013009	AATTT	2	10	4145	4154	40 %	60 %	0 %	0 %	254796404
88	NC_013009	GAA	2	6	4158	4163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254796404
89	NC_013009	A	7	7	4214	4220	100 %	0 %	0 %	0 %	254796404
90	NC_013009	CTAA	2	8	4232	4239	50 %	25 %	0 %	25 %	254796404
91	NC_013009	AGAT	2	8	4278	4285	50 %	25 %	25 %	0 %	254796404
92	NC_013009	AAG	2	6	4298	4303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254796404
93	NC_013009	ACT	2	6	4350	4355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254796404
94	NC_013009	T	6	6	4376	4381	0 %	100 %	0 %	0 %	254796404
95	NC_013009	TTG	2	6	4425	4430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254796404
96	NC_013009	ATG	2	6	4449	4454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254796404
97	NC_013009	TTA	2	6	4545	4550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254796404
98	NC_013009	A	6	6	4580	4585	100 %	0 %	0 %	0 %	254796404
99	NC_013009	GA	3	6	4670	4675	50 %	0 %	50 %	0 %	254796404
100	NC_013009	ATTT	2	8	4686	4693	25 %	75 %	0 %	0 %	254796404
101	NC_013009	AAG	2	6	4701	4706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254796404
102	NC_013009	ATT	2	6	4760	4765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254796404
103	NC_013009	T	6	6	4865	4870	0 %	100 %	0 %	0 %	254796404
104	NC_013009	ACT	2	6	4935	4940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254796405
105	NC_013009	GCC	2	6	4970	4975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254796405
106	NC_013009	GA	3	6	4997	5002	50 %	0 %	50 %	0 %	254796405
107	NC_013009	TGA	2	6	5005	5010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254796405
108	NC_013009	T	6	6	5165	5170	0 %	100 %	0 %	0 %	254796405
109	NC_013009	CT	3	6	5238	5243	0 %	50 %	0 %	50 %	254796405
110	NC_013009	CTAG	2	8	5285	5292	25 %	25 %	25 %	25 %	254796405
111	NC_013009	GTA	2	6	5293	5298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254796405
112	NC_013009	GA	3	6	5452	5457	50 %	0 %	50 %	0 %	254796405
113	NC_013009	GAT	2	6	5477	5482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254796405
114	NC_013009	CGT	2	6	5585	5590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254796405
115	NC_013009	GGA	2	6	5664	5669	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	254796405
116	NC_013009	GCTAGA	2	12	5684	5695	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	254796405
117	NC_013009	A	7	7	5714	5720	100 %	0 %	0 %	0 %	254796405
118	NC_013009	TCT	2	6	5846	5851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254796405
119	NC_013009	GAA	2	6	5858	5863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254796405
120	NC_013009	AAC	2	6	5872	5877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254796405
121	NC_013009	GGC	2	6	5890	5895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254796405
122	NC_013009	TG	3	6	5903	5908	0 %	50 %	50 %	0 %	254796405
123	NC_013009	A	6	6	5929	5934	100 %	0 %	0 %	0 %	254796405
124	NC_013009	T	6	6	5974	5979	0 %	100 %	0 %	0 %	254796406
125	NC_013009	CCT	2	6	5993	5998	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	254796406
126	NC_013009	T	6	6	6037	6042	0 %	100 %	0 %	0 %	254796406
127	NC_013009	CAA	2	6	6051	6056	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254796406
128	NC_013009	CTT	2	6	6077	6082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254796406
129	NC_013009	CGA	3	9	6131	6139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254796406
130	NC_013009	TCA	2	6	6141	6146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254796406
131	NC_013009	CA	3	6	6145	6150	50 %	0 %	0 %	50 %	254796406
132	NC_013009	GTT	2	6	6218	6223	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254796406
133	NC_013009	TA	3	6	6338	6343	50 %	50 %	0 %	0 %	254796406
134	NC_013009	ACTG	2	8	6359	6366	25 %	25 %	25 %	25 %	254796406
135	NC_013009	C	6	6	6407	6412	0 %	0 %	0 %	100 %	254796406
136	NC_013009	ATC	2	6	6453	6458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254796406
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138	NC_013009	A	6	6	6632	6637	100 %	0 %	0 %	0 %	254796407
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399	NC_013009	TG	3	6	20707	20712	0 %	50 %	50 %	0 %	254796422
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